En 1997, Grant Morrison fue el encargado de darle vida a una nueva encarnación de la Liga. A raíz de la invasión de la raza extraterrestre de los Marcianos Blancos, la raza que destruyó y exterminó a su raza hermana, los Marcianos Verdes, de la cual el Detective Marciano es su último miembro sobreviviente, Superman, Batman y Wonder Woman decidieron que el mundo necesitaba una vez más de una poderosa y bien organizada Liga de la Justicia, y reconstruyeron la base del equipo original formando un equipo con Aquaman, el Detective Marciano, con el nuevo Linterna Verde (Kyle Rayner) y Flash. Su nueva base, la nueva Atalaya, la Liga de la Justicia la estableció en la Luna. Al igual que las anteriores encarnaciones de la Liga, su lista no era estática e incluyó: Acero, Hombre Plástico, Manitou Raven, La Cazadora, Faith, Mayor Desastre y Zauriel.
Durante este largo período de la historia del equipo, la Liga de la Justicia lucho contra enemigos como la Liga de la Injusticia, Mageddon y Prometeo. Incluso, ellos viajaron en el tiempo para salvar a Aquaman en la historia de la edad obsidiana, luchando contra vampiros durante el arco argumental de la historia de Tenth Circle. En esta época el equipo fue muy popular. Debido a el reinicio de DC Comics, en esta encarnación de la Liga ya existe dicha continuidad.